電影: Shinichi Wakasa

由於一年前與哥吉拉的戰鬥，機龍雖然擊退了哥吉拉，但是機龍也損傷慘重失去了右手和絕對零度砲。 維修基地的成員中條義人一次與叔叔信一及外甥度假時，遇見了嬰兒島的小美人與摩斯拉，小美人並給他一個忠告：人類用哥吉拉的骨骸製造機龍其實是個嚴重的錯誤，若出動機龍，魔斯拉就會與人類為敵。於是信一想辦法說服老友同時也是首相的五十嵐希望能夠中止機龍的計畫，五十嵐首相因此陷入兩難，但此時日本的海邊發現了一具怪獸的屍體，經過調查怪獸似乎是遭到哥吉拉殺害，同時太平洋又出現了哥吉拉的蹤跡........

多年以前，人類以超級戰艦「轟天號」在南極擊敗了數度毀滅城市的怪獸王「哥吉拉」，並且將哥吉拉封印在南極的冰層下。但是地球除了哥吉拉以外，其實還有許許多多的怪獸正對著世界各大都市虎視眈眈。於是人類成立了專門對付各種怪獸的「地球防衛軍」。而地球防衛軍最強大的成員，就是當年封印哥吉拉的「轟天號」以及其艦長「道格拉斯·戈登上校」。 此外，為了應付怪獸對人類造成的困擾，地球防衛軍特別甄選出了有特殊能力的人類，由於這些人類擁有普通人類所沒有的「M染色體」，使得他們擁有比普通人更強大的體能跟敏捷性能夠應付怪獸...

在濃霧籠罩的北海道根室市，哥吉拉突然現身，不僅襲擊了城市，也將當地的發電廠給破壞殆盡，哥吉拉預測網站的工程師雄田浩二和記者一瀨由紀在現場目睹整個過程。 另一方面，日本危機管理局在日本海溝附近發現一顆巨大的岩塊，經偵測後得知裡面含有強力的磁性物質，可能是新發現的能源，正當危機管理局局長片桐光男下令打撈岩塊時，岩塊居然無預警的自動浮出水面，並且超越地球引力飛上天同時朝著哥吉拉所在的方向飛去......

卡美拉與加歐斯決戰後的冬天，北海道降下流星雨，同時一顆隕石墜落在支笏湖南西方約一公里處，陸上自衛隊第11師團隨即派出化學防護小隊，渡良瀬佑介二佐與花谷陸尉深入調查發現隕石似乎帶來了某種不明物體。 五天後，事件的原兇開始現身，札幌市地下鐵的電車在隧道內遭到不明生物攻擊，北海道札幌市的薄野出現巨大植物，巨大植物竄出一群體長3m，類似昆蟲的甲殼類生物。 怪蟲(Legion)與植物是與隕石一起飛來的地球外物體，兩者屬於共生關係，Legion會藉由啃食矽酮並分泌氧氣來製造植物(草體)，並藉由爆炸散佈種子...

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一日，曾令日本全國感到恐懼的巨大怪獸在死亡後，從災難解脫的國民們頓時欣喜若狂，並為這具充滿各種可能性的屍體被命名為「希望」，然而隨著希望之屍慢慢膨脹，在面對前所未有的緊急事態下，甚至可能會發生一場巨大的爆炸。因此首相直屬特工·帶刀新太（山田涼介 飾）和他的前同事、現為環境大臣秘書的 雨音雪乃 （土屋太鳳飾）接受了這場「善後處理」的任務。...

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